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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA La Estanzuela. |
Fecha : |
26/12/2018 |
Actualizado : |
05/07/2019 |
Tipo de producción científica : |
Capítulo en Libro Técnico-Científico |
Autor : |
GUTIERREZ, L.; BORGES, A.; QUERO, G.; GONZALEZ-REYMUNDEZ, A.; BERRO, I.; LADO, B.; CASTRO, A. |
Afiliación : |
Departamento de Biometría, Estadística y Computación, Facultad de Agronomía, Universidad de la República, Garzón 780, CP 12900, Montevideo, Uruguay.; Departamento de Biometría, Estadística y Computación, Facultad de Agronomía, Universidad de la República, Garzón 780, CP 12900, Montevideo, Uruguay.; Departamento de Biología Vegetal, Facultad de Agronomía, Universidad de la República, Garzón 780, CP 12900, Montevideo, Uruguay.; Departamento de Biometría, Estadística y Computación, Facultad de Agronomía, Universidad de la República, Garzón 780, CP 12900, Montevideo, Uruguay.; Departamento de Biometría, Estadística y Computación, Facultad de Agronomía, Universidad de la República, Garzón 780, CP 12900, Montevideo, Uruguay.; BETTINA LADO LINDNER, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay./1 Departamento de Biometría, Estadística y Computación, Facultad de Agronomía, Universidad de la República, Garzón 780, CP 12900, Montevideo, Uruguay.; Departamento de Producción Vegetal, Facultad de Agronomía, Universidad de la República, R3 Km 373, Paysandú, Uruguay. |
Título : |
Biostatistical tools for plant breeding in the genomics era. |
Fecha de publicación : |
2018 |
Fuente / Imprenta : |
In: German, S.; Quincke, M.; Vázquez, D.; Castro, M.; Pereyra, S.; Silva, P.; García, A. (Eds.). Seminario Internacional "1914-2014: Un siglo de mejoramiento de trigo en La Estanzuela". Montevideo (UY): INIA, 2018. |
Páginas : |
p.46-57. |
Serie : |
(INIA Serie Técnica; 241). |
ISBN : |
978-9974-38-406-4 |
ISSN : |
1688-9266 |
DOI : |
http://doi.org/10.35676/INIA/ST.241 |
Idioma : |
Inglés |
Contenido : |
SUMMARY:
Since the advent of agriculture, plant breeding has successfully improved plantsfor human benefit. Modern plant breeding
activities consist in evaluating the genetic merit of lines discerning genetic from environment and noise components. To do
so, modern plant breeding relies on the genetics foundations derived from Mendel?s work and statistical tools (or biometry)
generated afterwards. Plant breeding activities could be grouped in three categories: traditional, marker assisted
(MAS), and genomic selection (GS). Traditional plant breeding uses either per sephenotypic information, or information from
relatives to evaluate the genetic value. MAS on the other hand, involves the identification of markers linked to genes or quantitative
traits loci (QTL) of relevant traits, and then selecting individuals based on their marker scores. Finally, GS involves the prediction
of the genetic merit of individuals based on their marker scores and a statistical model. All of the three strategies require the
evaluation of large number of individuals creating massive amounts of data that needs proper analyses. Our objective was to
present some biostatistical strategies that are successfully being used in plant breeding programs. First, we used novel simulation |
Palabras claves : |
GENOMIC SELECTION; GENOTYPE BY ENVIRONMENT INTERACTION; GWAS; QTL MAPPING. |
Thesagro : |
GENOTIPOS. |
Asunto categoría : |
F01 Cultivo |
URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/12214/1/st-241-2018.p.46-57-Guitierrez-et-al.pdf
|
Marc : |
LEADER 02312naa a2200313 a 4500 001 1059383 005 2019-07-05 008 2018 bl uuuu u00u1 u #d 020 $a978-9974-38-406-4 022 $a1688-9266 024 7 $ahttp://doi.org/10.35676/INIA/ST.241$2DOI 100 1 $aGUTIERREZ, L. 245 $aBiostatistical tools for plant breeding in the genomics era.$h[electronic resource] 260 $c2018 300 $ap.46-57. 490 $a(INIA Serie Técnica; 241). 520 $aSUMMARY: Since the advent of agriculture, plant breeding has successfully improved plantsfor human benefit. Modern plant breeding activities consist in evaluating the genetic merit of lines discerning genetic from environment and noise components. To do so, modern plant breeding relies on the genetics foundations derived from Mendel?s work and statistical tools (or biometry) generated afterwards. Plant breeding activities could be grouped in three categories: traditional, marker assisted (MAS), and genomic selection (GS). Traditional plant breeding uses either per sephenotypic information, or information from relatives to evaluate the genetic value. MAS on the other hand, involves the identification of markers linked to genes or quantitative traits loci (QTL) of relevant traits, and then selecting individuals based on their marker scores. Finally, GS involves the prediction of the genetic merit of individuals based on their marker scores and a statistical model. All of the three strategies require the evaluation of large number of individuals creating massive amounts of data that needs proper analyses. Our objective was to present some biostatistical strategies that are successfully being used in plant breeding programs. First, we used novel simulation 650 $aGENOTIPOS 653 $aGENOMIC SELECTION 653 $aGENOTYPE BY ENVIRONMENT INTERACTION 653 $aGWAS 653 $aQTL MAPPING 700 1 $aBORGES, A. 700 1 $aQUERO, G. 700 1 $aGONZALEZ-REYMUNDEZ, A. 700 1 $aBERRO, I. 700 1 $aLADO, B. 700 1 $aCASTRO, A. 773 $tIn: German, S.; Quincke, M.; Vázquez, D.; Castro, M.; Pereyra, S.; Silva, P.; García, A. (Eds.). Seminario Internacional "1914-2014: Un siglo de mejoramiento de trigo en La Estanzuela". Montevideo (UY): INIA, 2018.
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Registros recuperados : 29 | |
1. | | MANCASSOLA, V.; ALLIAUME, F.; LADO, B.; QUINCKE, A.; PUENTES, R. Comparación de métodos para determinar la estabilidad estructural en suelos del Uruguay. Resumen: 172. In: Congreso Latinoamericano de Ciencias de Suelo, 22.; 2do Congreso Uruguayo de Suelos, 2; Encuentro de la SUCS, 10. Diversidad Productiva:
pilar del manejo sostenible de los suelos. Montevideo, Uruguay: SUCS; SLSC, 2019. [Presentación Oral] + [Resumen].Tipo: Presentaciones Orales |
Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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2. | | GUTIÉRREZ, L.; LADO, B.; GONZÁLEZ, P.; SILVA, P.; QUINCKE, M. Handling Genotype-By-Environment Interaction in Genomic Selection to Predict New Genotypes and New Environments. [P0814] In: International Plant & Animal Genome, Conference PAG XXIV, "The largest Ag-genomics Meeting in the World San Diego, CA, USA; January 9-13, 2016. [Abstract] .Tipo: Abstracts/Resúmenes |
Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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3. | | CASTRO, M.; VÁZQUEZ, D.; VON ZITZEWITZ, J.; LADO, B. Influence of terminal drought stress on wheat agronomic traits, industrial quality and dehydrin proteins. In: INTERNATIONAL WHEAT CONFERENCE, 8., 2010 , St. Petersburg, RU. Abstracts...: wheat genetics and breeding for abiotic stresses; poster presentations. St. Petersburg, RU: VIR, 2010. p. 157.Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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6. | | PEDROZO, P.; MOLTINI, A.; PINTOS, P.; LUQUE, E.; VICENTE, E.; LADO, B.; FARIÑA, L.; LADO, J. Avances y desafíos en la mejora del sabor de nuestras frutillas. Agroalimentos. Revista INIA Uruguay, Diciembre 2021, no.67, p.63-67. (Revista INIA; 67).Tipo: Artículos en Revistas Agropecuarias |
Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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7. | | GUTIERREZ, L.; BORGES, A.; QUERO, G.; GONZALEZ-REYMUNDEZ, A.; BERRO, I.; LADO, B.; CASTRO, A. Biostatistical tools for plant breeding in the genomics era. In: German, S.; Quincke, M.; Vázquez, D.; Castro, M.; Pereyra, S.; Silva, P.; García, A. (Eds.). Seminario Internacional "1914-2014: Un siglo de mejoramiento de trigo en La Estanzuela". Montevideo (UY): INIA, 2018. p.46-57. (INIA Serie Técnica; 241).Tipo: Capítulo en Libro Técnico-Científico |
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8. | | LADO,B.; BATTENFIELD, S.; POLAND, J.; QUINCKE, M.; SILVA, P.; GUTIÉRREZ, L. Comparación de metodologías de predicción de cruzamientos para rendimiento en trigo. MV 14 - COMUNICACIONES LIBRES - MV. MEJORAMIENTO VEGETAL In: JOURNAL OF BASIC & APPLIED GENETICS, 2016, Vol.27, Iss. 1 (Supp.). XVI LATIN AMERICAN CONGRESS OF GENETICS, IV CONGRESS OF THE URUGUAYAN SOCIETY OF GENETICS, XLIX ANNUAL MEETING OF THE GENETICS SOCIETY OF CHILE, XLV ARGENTINE CONGRESS OF GENETICS, 9-12 October 2016. PROCEEDINGS. Montevideo (Uruguay): SAG, 2016 p. 287.Tipo: Trabajos en Congresos/Conferencias |
Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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9. | | WLASIUK, B.; RAMOS, S.; ARIAS-SIBILLOTTE, M.; LADO, B.; CABRERA, D.; RODRIGUEZ, P.; SEVERINO, V. Evaluation of different bud break promoters on 'Williams' (Pyrus communis L.) pear. [Conference paper]. Acta Horticulturae, February 2021, N°1303, p. 305-312. DOI: https://doi.org/10.17660/ActaHortic.2021.1303.43 Article history: Published 5 February 2021. In: Acta Horticulturae (ISHS) 1303: XIII International Pear Symposium, Montevideo, Uruguay. Conveners: Roberto Zoppolo, Danilo Cabrera. Editors: Roberto Zoppolo, Danilo Cabrera, D. Granatstein.Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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10. | | LADO, B.; MATUS, I.; BELZILE, F.; POLAND, J.; QUINCKE, M.; CASTRO, M.; VON ZITZEWITZ, J. Genotipado por secuenciación en trigo (Triticum aestivum). In: JORNADAS DE LA SOCIEDAD DE BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR , 8., SIMPOSIO BIOLOGÍA Y BIOTECNOLOGÍA VEGETAL, 11., 2013. Resumen. Montevideo: SBBM, SUB, 2013.Tipo: Abstracts/Resúmenes |
Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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11. | | LADO, B.; GONZÁLEZ BARRIOS, P.; QUINCKE, M.; SILVA, P.; GUTIÉREZ, L. Genomic selection in wheat breeding program modelling genotype by environment interaction using mixed models. In: International Wheat Conference, 9., 2015, Sydney, AU. Program and abstracts: posters. Sidney: ICMS Australasia, 2015. p. 168.Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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13. | | LADO, B.; VÁZQUEZ, D.; QUINCKE, M.; SILVA, P.; AGUILAR, I.; GUTIÉRREZ, L. Resource allocation optimization with multi-trait genomic prediction for bread wheat (Triticum aestivum L.) baking quality. [Original article]. Theoretical and Applied Genetics, 1 December 2018, Volume 131, Issue 12, pp. 2719-2731. OPEN ACCESS. Article history: Received: 29 January 2018 / Accepted: 10 September 2018 / Published online: 19 September 2018.
Supplementary materials.
Acknowledgements: We express our appreciation for the effort of the technical personnel of INIA La...Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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15. | | SILVA, P.; LADO, B.; BRANDARIZ, S.; PEREYRA, S.; GERMAN, S.; VON ZITZEWITZ, J.; GUTIÉRREZ, L.; QUINCKE, M. Herramientas utilizadas y avances en mejoramiento molecular en el Programa de Mejoramiento Genético de Trigo de INIA Uruguay.[Presentación oral]. In: SEMINARIO INTERNACIONAL DE TRIGO, 2014, La Estanzuela, Colonia, UY. GERMÁN, S., et al. (Org.). 1914-2014, un siglo de mejoramiento de trigo en La Estanzuela: un valioso legado para el futuro: presentaciones; resúmenes. La Estanzuela, Colonia, UY: INIA, 2014. p. 81.Tipo: Presentaciones Orales |
Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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16. | | SILVA, P.; LADO, B.; BRANDARIZ, S.; BERRO, I.; GUTIÉRREZ, L.; PEREYRA, S.; GERMAN, S.; VON ZITZEWITZ, J.; QUINCKE, M. Herramientas utilizadas y avances en mejoramiento molecular en el programa de mejoramiento genético de trigo de Inia Uruguay. In: German, S.; Quincke, M.; Vázquez, D.; Castro, M.; Pereyra, S.; Silva, P.; García, A. (Eds.). Seminario Internacional "1914-2014: Un siglo de mejoramiento de trigo en La Estanzuela". Montevideo (UY): INIA, 2018. p. 277-285. (INIA Serie Técnica; 241).Tipo: Capítulo en Libro Técnico-Científico |
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17. | | MORA, F.; CASTILLO, D.; LADO, B.; MATUS, I.; POLAND, J.; BELZILE, F.; VON ZITZEWITZ, J.; DEL POZO, A. Genome-wide association mapping of agronomic traits and carbon isotope discrimination in a worldwide germplasm collection of spring wheat using SNP markers. Molecular Breeding, 2015, v,35, no.2, 12 p.Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : Internacional - -- |
Biblioteca(s): INIA La Estanzuela; INIA Las Brujas. |
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18. | | LADO, B.; BATTENFIELD, S.; SILVA, P.; QUINCKE, M.; GUZMAN, C.; SINGH, R.P.; DREISIGACKER, S.; PEÑA, J.; FRITZ, A.; POLAND, J.; GUTIERREZ, L. Comparing strategies to select crosses using genomic prediction in two wheat breeding programs. In: International Wheat Genetics Symposium, 12, Tulln, Austria; April 23-28, 2017; BOKU: University of Natural Resources and Life Sciences, Vienna, Austria. p.88-90.Tipo: Trabajos en Congresos/Conferencias |
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19. | | LADO, B.; POLAND, J.; BELZILE, F.; DEL POZO, A.; MATUS, I.; RODRÍGUEZ, A.; INOSTROZA, L.; LOBOS, G.A.; CASTRO, M.; QUINCKE, M.; LANDECHEA, L.; VON ZITZEWITZ, J. Genotipado por secuenciación del genoma de 384 genotipos de T. aestivum para selección genómica. BAG. Journal of Basic and Applied Genetics ,Ciudad Autónoma de Buenos Aires, v.23, supl.1, p. 267, 2012.Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : B - 3 |
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20. | | BRANDARIZ, S.P.; GONZÁELZ-REYMÚNDEZ, A.; LADO, B.; QUINCKE, M.; VON ZITZEWITZ, J.; CASTRO, M.; MATUS, I.; DEL POZO, A.; GUTIÉRREZ, L. Effect of using imputed missing data on QTL detection on a wheat GWAS panel. In: SEMINARIO INTERNACIONAL DE TRIGO, 2014, La Estanzuela, Colonia, UY. GERMÁN, S., et al. (Org.). 1914-2014, un siglo de mejoramiento de trigo en La Estanzuela: un valioso legado para el futuro: posters; resúmenes. La Estanzuela, Colonia, UY: INIA, 2014. p. 86.Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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